MySQL5.6の文字コード設定が分からない

環境：Vagrant上のUbuntu14.04

MySQLはapt-get installで入れた5.5をhttp://dev.mysql.com/get/mysql-apt-config_0.8.0-1_all.debを使って5.6にアップグレードした。

文字コードを全部utf8mb4にしようとしていて、設定はすべて/etc/mysql/my.cnfに書いた。作業しているOSユーザがrootの場合は希望通りの設定となっていたのだが、別のOSユーザでDB接続した際には設定が違っていてびっくりした。

OSユーザが違うことで適用される設定が変わるとかあるのでしょうか……？

tusui@hogehoge:~$ sudo su - root
root@hogehoge:~# mysql -uroot -p

rootユーザで接続すると

Welcome to the MySQL monitor.  Commands end with ; or \g.
Your MySQL connection id is 2
Server version: 5.6.35 MySQL Community Server (GPL)

Copyright (c) 2000, 2016, Oracle and/or its affiliates. All rights reserved.

Oracle is a registered trademark of Oracle Corporation and/or its
affiliates. Other names may be trademarks of their respective
owners.

Type 'help;' or '\h' for help. Type '\c' to clear the current input statement.

mysql> show variables like '%character%';
+--------------------------+----------------------------+
| Variable_name            | Value                      |
+--------------------------+----------------------------+
| character_set_client     | utf8mb4                    |
| character_set_connection | utf8mb4                    |
| character_set_database   | utf8mb4                    |
| character_set_filesystem | binary                     |
| character_set_results    | utf8mb4                    |
| character_set_server     | utf8mb4                    |
| character_set_system     | utf8                       |
| character_sets_dir       | /usr/share/mysql/charsets/ |
+--------------------------+----------------------------+
8 rows in set (0.00 sec)

mysql> show variables like '%collat%';
+----------------------+--------------------+
| Variable_name        | Value              |
+----------------------+--------------------+
| collation_connection | utf8mb4_general_ci |
| collation_database   | utf8mb4_general_ci |
| collation_server     | utf8mb4_general_ci |
+----------------------+--------------------+
3 rows in set (0.00 sec)

utf8mb4ベースになっている。

tusui@hogehoge:~$ mysql -uroot -p

とrootじゃないOSユーザで接続すると

Welcome to the MySQL monitor.  Commands end with ; or \g.
Your MySQL connection id is 1
Server version: 5.6.35 MySQL Community Server (GPL)

Copyright (c) 2000, 2016, Oracle and/or its affiliates. All rights reserved.

Oracle is a registered trademark of Oracle Corporation and/or its
affiliates. Other names may be trademarks of their respective
owners.

Type 'help;' or '\h' for help. Type '\c' to clear the current input statement.

mysql> show variables like '%character%';
+--------------------------+----------------------------+
| Variable_name            | Value                      |
+--------------------------+----------------------------+
| character_set_client     | utf8                       |
| character_set_connection | utf8                       |
| character_set_database   | utf8mb4                    |
| character_set_filesystem | binary                     |
| character_set_results    | utf8                       |
| character_set_server     | utf8mb4                    |
| character_set_system     | utf8                       |
| character_sets_dir       | /usr/share/mysql/charsets/ |
+--------------------------+----------------------------+
8 rows in set (0.00 sec)

mysql> show variables like '%collat%';
+----------------------+--------------------+
| Variable_name        | Value              |
+----------------------+--------------------+
| collation_connection | utf8_general_ci    |
| collation_database   | utf8mb4_general_ci |
| collation_server     | utf8mb4_general_ci |
+----------------------+--------------------+
3 rows in set (0.00 sec)

なぜ……？

この状態からset names utf8mb4すると、rootユーザと同じ設定になる。

追記

次の日、vagrant upしてrootユーザ以外で接続すると、期待通りのcharacter set、collationになっていたとさ……。